MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009051	GATC	2	8	2082513	2082520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_009051	A	6	6	2082537	2082542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009051	TC	3	6	2082763	2082768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_009051	GCC	2	6	2082803	2082808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_009051	GCTC	2	8	2082854	2082861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_009051	CCCG	2	8	2082876	2082883	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5507	NC_009051	GAT	2	6	2082927	2082932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_009051	ACG	2	6	2082984	2082989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_009051	CGG	2	6	2083029	2083034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_009051	GCC	2	6	2083055	2083060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_009051	GCA	2	6	2083072	2083077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_009051	CGC	2	6	2083128	2083133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_009051	CGGC	2	8	2083143	2083150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_009051	GCG	2	6	2083170	2083175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_009051	TTC	2	6	2083237	2083242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_009051	AGC	2	6	2083407	2083412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_009051	GCG	2	6	2083438	2083443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_009051	AC	3	6	2083487	2083492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_009051	CGAC	2	8	2083501	2083508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_009051	TA	3	6	2085041	2085046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_009051	GGAC	2	8	2085070	2085077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_009051	CCA	2	6	2085566	2085571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_009051	TTC	2	6	2089503	2089508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_009051	C	6	6	2089508	2089513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5525	NC_009051	CGG	2	6	2090912	2090917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_009051	TGCC	2	8	2090951	2090958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_009051	G	7	7	2091503	2091509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_009051	G	6	6	2091577	2091582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_009051	GAG	2	6	2091649	2091654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_009051	TTA	2	6	2091687	2091692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_009051	GC	3	6	2092019	2092024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_009051	GTCCC	2	10	2092586	2092595	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5533	NC_009051	GAG	2	6	2094733	2094738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009051	CTG	2	6	2095776	2095781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_009051	GCA	2	6	2095799	2095804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_009051	TCT	2	6	2095878	2095883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_009051	CGT	2	6	2095934	2095939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_009051	AAT	2	6	2095969	2095974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_009051	ATT	2	6	2096049	2096054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_009051	TTC	2	6	2096063	2096068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_009051	TTC	2	6	2096081	2096086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_009051	CCGG	2	8	2096100	2096107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_009051	ACA	2	6	2096119	2096124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_009051	ATA	2	6	2096161	2096166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_009051	AC	3	6	2096198	2096203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_009051	GGA	2	6	2096212	2096217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_009051	T	7	7	2100465	2100471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009051	GCA	2	6	2100495	2100500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_009051	GCG	2	6	2100530	2100535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_009051	ATT	2	6	2100601	2100606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_009051	ATT	2	6	2100634	2100639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_009051	CGG	2	6	2100646	2100651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_009051	T	6	6	2100667	2100672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009051	GAG	2	6	2101468	2101473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_009051	CTC	2	6	2101476	2101481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_009051	AAT	2	6	2101752	2101757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_009051	AAC	2	6	2101927	2101932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_009051	ATC	2	6	2101938	2101943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_009051	CTTC	2	8	2101977	2101984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_009051	T	7	7	2103245	2103251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009051	TCA	2	6	2103312	2103317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_009051	CCG	2	6	2103322	2103327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_009051	C	8	8	2103364	2103371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5564	NC_009051	TCA	2	6	2103388	2103393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_009051	ACC	2	6	2103395	2103400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_009051	T	7	7	2103433	2103439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_009051	TTG	2	6	2105977	2105982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_009051	TCA	2	6	2106012	2106017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_009051	TTG	2	6	2106019	2106024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009051	CT	3	6	2106096	2106101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_009051	ACA	2	6	2106114	2106119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_009051	GATA	2	8	2106141	2106148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_009051	ATA	2	6	2106152	2106157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_009051	TAT	3	9	2107491	2107499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_009051	CTC	2	6	2107565	2107570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_009051	TCT	2	6	2107605	2107610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_009051	CAGT	2	8	2107612	2107619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5578	NC_009051	TCG	2	6	2107659	2107664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_009051	ATT	2	6	2107676	2107681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_009051	AGT	2	6	2107691	2107696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_009051	CGG	2	6	2107792	2107797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_009051	CCGGGG	2	12	2108577	2108588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_009051	A	6	6	2108599	2108604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_009051	CTA	2	6	2108614	2108619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_009051	CGTT	2	8	2108672	2108679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_009051	CAC	2	6	2108751	2108756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_009051	TCC	2	6	2108779	2108784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_009051	AGG	2	6	2108812	2108817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_009051	CCA	2	6	2108837	2108842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_009051	GAGGTC	2	12	2108844	2108855	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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5592	NC_009051	TTG	2	6	2108906	2108911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_009051	GCC	2	6	2108918	2108923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_009051	GAA	2	6	2109230	2109235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_009051	AGA	2	6	2109269	2109274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_009051	ATC	2	6	2109304	2109309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_009051	TCA	2	6	2109317	2109322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_009051	CGATCA	2	12	2109338	2109349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_009051	TCG	2	6	2109356	2109361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_009051	GAA	2	6	2109412	2109417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_009051	ACCT	2	8	2109516	2109523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_009051	TC	3	6	2110713	2110718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_009051	AAG	2	6	2110719	2110724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_009051	ATC	2	6	2111830	2111835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_009051	AGA	2	6	2111896	2111901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_009051	TA	3	6	2111917	2111922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_009051	TTCA	2	8	2111965	2111972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5608	NC_009051	TTA	2	6	2111974	2111979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_009051	AAT	2	6	2111986	2111991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_009051	ATT	2	6	2112062	2112067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_009051	GCC	3	9	2112093	2112101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_009051	ATCT	2	8	2112156	2112163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_009051	CTA	2	6	2112241	2112246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_009051	GTTTG	2	10	2112278	2112287	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_009051	TCCT	2	8	2112317	2112324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_009051	CAA	2	6	2112358	2112363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_009051	T	6	6	2112379	2112384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_009051	T	6	6	2112801	2112806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_009051	TAC	2	6	2112831	2112836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_009051	TTAA	2	8	2112894	2112901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_009051	GGCG	2	8	2113074	2113081	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_009051	CCG	2	6	2113085	2113090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_009051	GGAC	2	8	2113091	2113098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5624	NC_009051	CCG	2	6	2113109	2113114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_009051	GCC	2	6	2113115	2113120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_009051	CAGG	2	8	2117063	2117070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_009051	CAA	2	6	2117074	2117079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_009051	CTG	2	6	2118084	2118089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_009051	GTT	2	6	2118109	2118114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_009051	AT	3	6	2118139	2118144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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